Puis en 1966, alors que l'Etat de Genève s'apprêtait à doter l'enseignement musical d'un appui décisif, il était important de maintenir la présence active du mécénat: ainsi fut fondée la Société auxiliaire du Conservatoire, qui contribua à diverses opérations – telles que l'achat d'instruments coûteux, la création du studio d'enregistrement – que ne pouvait pas assumer le seul budget de l'institution.

Au fil des années il apparut qu'une fusion des deux associations rendrait leur action plus efficace. Ainsi naquit en janvier 1995 la Société des Amis et Anciens Elèves du Conservatoire de Musique de Genève, qui a repris, en les coordonnant, les objectifs des associations fondatrices, tout en s'attachant à aider des étudiants dans le cadre de leurs études.